口腔系成立于2009年，现有口腔医学和口腔医学技术两个专业。口腔医学专业创办于2002年，为中等医学教育。2004年学校升格为沧州医学高等专科学校，开始独立招收专科层次口腔医学专业学生。从2005 ～ 2011年曾开办口腔医学技术专业，2021年恢复口腔医学技术专业的招生，采用校院联合培养（1.5+1.5）的模式。口腔系设有口腔内科教研室、口腔外科教研室、口腔修复教研室、口腔正畸教研室、口腔基础教研室等5个专业教研室和1个口腔实训中心，能够承担口腔医学、口腔医学技术2个专业所有专业课程的教学。

口腔系现有专任教师33人，其中硕士研究生21人，占教师总数的63.6%；高级职称10人，占教师总数的30.3%；中青年骨干教师12名，专任教师中“双师素质”教师21人，占专任教师总数的63.6% ；积极从行业一线聘请专家担任兼职教师20余人，打造形成了以专业带头人和骨干教师为核心、专兼结合、结构合理的高水平专业教师团队。

实践教学条件优越，校内口腔实训中心3880平方米，仪器设备总值1200万元，建有口腔临床实训室、口腔临床模拟实训室、口腔综合实训室等专业实训室20个，教学仪器设备配套齐全，能完全满足专业教学要求，实验教学开出率100%；口腔实训中心曾连续8年承担了国家口腔执业助理医师实践技能考试。

口腔系在办学过程中，始终坚持以创新人才培养为目标，以科学育人为根本，积极探索教育教学改革，加强专业和师资队伍建设，秉承“学生为本、就业导向”的办学理念，注重学生职业能力和综合素质培养，实现了专业课程与口腔临床实际岗位、口腔义齿加工行业实际岗位的对接，努力为社会培养和输送优秀的口腔专业人才。